學歷：
臺灣大學歷史系學士 (1980)
臺灣大學歷史研究所碩士 (1983)
美國普林斯頓大學博士 (1992)

現職：
中央研究院歷史語言研究所特聘研究員 (2005.9- )
國立清華大學歷史研究所兼任教授 (1998.10- )
國立臺灣大學歷史系兼任教授 (1998.10- )

國立成功大學客座特聘講座教授(2021.12-)

主要經歷：
中央研究院副院長 (2010.1-2016.8)，中央研究院代理院長 (2016.5-2016.6)
中央研究院歷史語言研究所助理研究員 (1985.8-1993.5)，副研究員 (1993.5-1998.10)，研究員 (1998.10-2005.9)
中央研究院歷史語言研究所副所長 (1994.6-1995.7)，所長 (2003.10-2009.10)
中央研究院法律學研究所代理所長 (2011.10-2012.1)
中央研究院蔡元培人文社會科學研究中心主任 (2003.1-2004.6)
「數位典藏與數位學習國家型科技計畫」總主持人 (2010-2012)
Pacific Neighborhood Consortium主席 (2011-2016)
國家科學委員會人文及社會科學處副處長 (2000.1-6)，處長 (2000.7-2002.12)
國家科學委員會歷史學門諮議委員 (2003-2005)